وب سایت ژنوم حیوانات

موارد جدید در وب سایت ژنوم حیوانات NAGRP (#1، 2025)
ترجمه گوگل

******************************************** **************************

** یادداشت ویژه در مورد QTLdb و CorrDB انتشار آینده:

در 20 سال گذشته، ما مرتباً نسخه‌های جدیدی را منتشر کرده‌ایم
Animal QTLdb (و Animal CorrDB از سال 2012) با اضافه شدن موارد جدید
داده های انتخاب شده همانطور که ما نسخه فعلی را اعلام می کنیم (در زیر)، می خواهیم شما باشید
آگاه باشید که ممکن است نتوانیم انتشارات آینده را در فواصل زمانی معمول انجام دهیم
به دلیل قطع تامین مالی مگر اینکه منابع جدید بودجه ایمن باشد،
ما باید تمام داده های فعلی را در جایی سپرده گذاری کنیم و پایگاه داده را متوقف کنیم
توسعه.
********************************************** **************************

o اعلام نسخه Animal QTLdb Release 55 و CorrDB Release 23:

(23 دسامبر 2024): مجموع 11506 QTL/ انجمن جدید در
پایگاه داده (الحاقات جدید کمتر منسوخ شده/حذف شده: گاو: 89;
مرغ: 9,842; بز: 324; اسب: 9; خوک: 927; گوسفند: 315; قزل آلای رنگین کمان: 0
-- افزایش خالص: 11,506). تا به امروز، تعداد کل فعلی QTL در
پایگاه داده: 289,348 [تجزیه بر اساس گونه -- گاو: 192,336 (بر روی 553 صفت).
مرغ: 28444 (در 245 صفت)؛ بز: 2469 (در 82 صفت)؛ اسب: 2225
(در 60 صفت)؛ خوک: 56615 (در 403 صفت)؛ گوسفند: 5058 (در 170 صفت)؛
قزل آلای رنگین کمان: 2201 (در 35 صفت)].

علاوه بر این، 13830 به روز رسانی به داده های قبلی در گاو انجام شد.
مرغ، بز، خوک و گوسفند QTLdb.

در مورد توسعه پایگاه داده:
(1) به روز رسانی های متفرقه برای QTLdb پرسش های متداول و وب سایت.
(2) بهبودهای متعددی در ابزار متصدی انجام شد.

آدرس اینترنتی: https://www.animalgenome.org/QTLdb

(23 دسامبر 2024): مجموع 4484 همبستگی جدید و 7121 داده وراثت پذیری
در CorrDB [همبستگی های جدید بر اساس گونه ها - Pig: 680;
گاو: 345; مرغ: 1165; گوسفند: 2,066; بز: 228] و جمع 693 جدید
داده های وراثت پذیری [تجزیه بر اساس گونه -- خوک: 114; گاو: 84; مرغ:
84; گوسفند: 461; Goat: 27] در CorrDB سرپرستی شده است.
تا به امروز، تعداد کل داده های همبستگی در پایگاه داده: 42436
[تجزیه بر اساس گونه -- گاو: 16032 (در 368 صفت، 359 صفت
انواع)؛ مرغ: 3771 (در 93 صفت، 157 نوع صفت)؛ اسب: 209
(در 27 صفت، 131 نوع صفت)؛ خوک: 12871 (در 239 صفت، 335 صفت
انواع)؛ گوسفند: 5570 (در 111 صفت، 302 نوع صفت)؛ بز: 3983
(بر روی 90 صفت، 176 نوع صفت)]، و در مجموع 7121 داده وراثت پذیری
[تجزیه بر اساس گونه -- گاو: 2873 (در 421 صفت، 374 نوع صفت).
مرغ: 620 (در 155 صفت، 143 نوع صفت)؛ اسب: 131 (در 54 صفت،
1 نوع صفت)؛ خوک: 2044 (در 279 صفت، 378 نوع صفت)؛ گوسفند:
1016 (در 147 صفت، 309 نوع صفت)؛ بز: 514 (در 84 صفت، 142
متغیرهای صفت)] از 719 نشریه تهیه شده است.

به روز رسانی داده ها به 1406 همبستگی انجام شد (مرغ: 147؛ بز: 466؛ خوک:
745; گوسفند:48) و داده های وراثت پذیری 462 (گاو: 21؛ مرغ: 16؛ خوک:
412; گوسفند: 13) قبل از آخرین انتشار داده ها سرپرستی شده است.

آدرس اینترنتی: https://www.animalgenome.org/CorrDB


o تحولات هستی شناسی

(1) ده (10) انتشار داده های هستی شناسی صفت مهره داران (VT) با
تغییرات ساختاری و به روز رسانی اضافه/حذف داده ها. اصطلاح فعلی
تعداد 3817 است.

  URL: https://www.animalgenome.org/bioinfo/projects/vt/

(2) سه (3) اطلاعات هستی شناسی نژاد دام (LBO) منتشر شد
(نسخه فعلی 1125 اصطلاح دارد). علاوه بر این، نژاد دام
انتشار داده های هستی شناسی (LBO) دارای قالب نام گذاری نسخه جدیدی است که نشان دهنده آن است
تاریخ نسخه در قالب 'yyyy-mm-dd'. مثلا نسخه 9.8 آن است
اکنون "نسخه 2024-11-25" نامیده می شود.

آدرس اینترنتی: https://www.animalgenome.org/bioinfo/projects/lbo/

(3) داده های هستی شناسی اندازه گیری بالینی (CMO) دو بار به روز شد
از Bioportal به محیط مدیریت محلی QTLdb/CorrDB و برای
مرورگرها و بینندگان سلسله مراتب هستی شناسی

آدرس اینترنتی: https://www.animalgenome.org/bioinfo/projects/cmo/

همه کارهای توسعه هستی شناسی صفت با داده های QTLdb/CorrDB مرتبط هستند
مراقبت و نگهداری این تا حدی در QTL/CorrDB منعکس شده است
به روز رسانی های شرح داده شده در بالا


o عملکرد QTLdb و CorrDB ممکن است به پایان برسد

QTLdb و CorrDB دیگر به طور فعال تأمین مالی نمی شوند. این بدان معنی است که در
در آینده نزدیک، این داده ها و ابزارهای مرتبط دیگر فعال نخواهند بود
به روز می شود مگر اینکه منابع مالی اضافی مشخص شود. QTLdb و CorrDB
بیش از 20 و 10 سال است که به طور فعال از طریق کمک های مالی تأمین مالی شده اند
به ترتیب. ما به جستجوی منابع مالی جایگزین ادامه خواهیم داد
و هنگامی که این منابع به حالت ایستا منتقل می شوند، به روز رسانی های اضافی را ارائه می دهد
دولت

o منابع مالی جدید برای وب سایت ژنوم حیوانات NAGRP

وب‌سایت animalgenome.org اکنون عمدتاً توسط وزارت کشاورزی ایالات متحده آمریکا-NIFA تأمین مالی می‌شود
کمک هزینه هماهنگی تحقیقاتی (RCN) با حمایت بیشتر از t

کتاب اصلاح نژاد دامهای اهلی -ژنوم ویژگی ها ، گزینش و آمیخته گیری - انتشارات دانشگاه تبریز

پیشگفتار مترجم

در سال‌های اخیر پیشرفت های شگرف و انقلاب گونه‌ای در مباحث ژنتیک و اصلاح نژاد دام‌های اهلی پدید آمده است که امکان پیشرفت صفات تولیدی را بسیار سریعتر کرده است. به‌نظر می‌رسد مباحث کتاب های خارجی منتشر شده پیش از سال2000 میلادی بیشتر به ژنتیک کلاسیک می‌پردازند ولی بعد از سال 2000 فصل‌های جدیدی در این علم با عنوان ژنومیک و کاربرد ژنتیک مولکولی در کتابها مطرح شده است که پیش از این کمتر به آن پرداخته می‌شد. کتاب‌های فارسی موجود در بازار در زمینه اصلاح دام نیز به‌طور نسبی کمتر مباحث جدید اصلاح دام را مطرح کرده‌اند. برتری اصلی این کتاب، پرداختن به فصل های جدیدی از این علم با عنوان ژنومیک، نقشه ژنتیکی، نقشه فیزیکی، نقشه یابی ژنوم، همسانه سازی، بیان ژن، نشانگر ژنتیکی، ریز ماهواره، پروتئوم، تراشه، توالی‌یابی، اسنیپ، ترانسژنز، تشخیص ژنوتیپ مولکولی و ...است که در کتاب های فارسی موجود در بازار جای خالی آن احساس می‌شود.  براساس اظهار مولفان، این کتاب در اصل برای اساتید و با هدف آموزشی نگاشته شده است تا بهتر بتوانند مفاهیم دشوار ژنتیک را به آسانی به دانشجویان آموزش دهند. سازماندهی کتاب در12 فصل به صورتی است که ابتدا اصول را بیان می‌کند و سپس مطالب عمیق تر را به کمک تصویر‌ها و نمودار‌ها روشن تر بیان می‌کند. استفاده از جدول، شکل و عکس‌های مناسب سبب ارایه اطلاعات کامل به خواننده می‌شود. در نتیجه، کتاب برای دانشجویان علوم دامی، دبیران دبیرستان های دامپروری، دانشجویان کارشناسی ارشد و دکتری حرفه‌ای دامپزشکی و مروجان اصلاح نژاد دام جالب توجه است. این کتاب با داشتن تصویر‌ها و مثال های به روز، فهم مطالب را آسانتر می‌کند.

فرانسه از جمله کشورهای پیشرو در زمینه دامپروری و اصلاح دام است که انتشارات علمی سطح بالایی دارد. هدف از ترجمه این کتاب آشنایی بیشتر محققان و دانشجویان با دستاورد‌ها و سیستم اصلاح نژاد دام در فرانسه است که تاکنون کمتر کتابی به زبان فرانسه در این زمینه به فارسی برگردان شده است. مترجم در طول مدت تحصیل دوره دکتری در فرانسه، (2004 الی 2007) در سمینارها و کارگاه های آموزشی و بازدیدهای علمی (برای مثال مرکز ژنتیک کمی و اصلاح نژاد ژوی آن ژوزاس[1] ‌پاریس، آزمایشگاه ژنتیک مولکولی نانت[2]) با تعدادی از محققان موسسه پژوهش‌های کشاورزی فرانسه که نتایج کارهای پژوهشی آنان در کتاب آمده است، بحث و گفتگوهای علمی داشته است. امید است که اطلاعات کتاب برای علاقمندان ژنتیک و به نژادی دام قابل استفاده باشد.