دوره بین المللی
ترجمه گوگل
پیشبینی صفات پیچیده با استفاده از دادههای بزرگ ژنومی و محیطی:
مفاهیم، مدل ها، نرم افزار و تمرین.
10 تا 14 مارس 2025
موسسه ملی تحقیقات کشاورزی (INIA)
مونته ویدئو، اروگوئه
مربی:
گوستاوو د لس کامپوس
استاد گروه اپیدمیولوژی و آمار زیستی و آمار و
احتمال، دانشگاه ایالتی میشیگان، ایالات متحده آمریکا. ایمیل: gustavoc@msu.edu .
شرح دوره:
آیا می خواهید یاد بگیرید که چگونه کشاورزی پیچیده را پیش بینی کنید (گیاهان، درختان،
حیوانات) و فنوتیپ های بیماری و خطرات در انسان و حیوانات با استفاده از DNA
نشانگرها؟ در این دوره پنج روزه، مفاهیم کلیدی زیربنای پیش بینی و
متداول ترین مدل های مورد استفاده معرفی خواهند شد، از جمله BLUP ژنومی،
روشهای انتخاب متغیر جریمه شده و رگرسیون خطی بیزی،
روش های غیر خطی (رگرسیون هسته، شبکه های عصبی و XGBoost).
عوامل موثر بر عملکرد پیش بینی مورد بحث قرار خواهد گرفت.
این دوره شامل ماژول هایی است که هر کدام شامل یک مقدمه مختصر است که در ادامه می آید
با کار گروهی عملی با استفاده از داده های در دسترس عموم و نرم افزار منبع باز.
تمرکز در درجه اول بر روی پیش بینی به کمک ژنوم با استفاده از نشانگرهای DNA است اما
نمونه هایی با استفاده از داده های محیطی پوشش داده شده است. درک خوب از
احتمال و استنتاج در مدل های خطی و تجربه کار با R
مورد نیاز است. لطفاً لپ تاپ خود را با نسخه فعلی R نصب شده همراه داشته باشید.
محتوای دوره:
1- پیش بینی ژنومی صفات پیچیده: اصول
2- انتخاب متغیر با استفاده از رگرسیون تک نشانگر
3- برآورد انقباض (رگرسیون برآمدگی و توقف اولیه)
4- مدل های انقباض بیزی و انتخاب متغیر
5- رگرسیون نیمه پارامتریک با استفاده از فضاهای بازتولید کرنل هیلبرت
6- پیش بینی ژنومی با استفاده از XGBoost
7- Sparse GBLUP
8- پیش بینی ژنومی چند صفتی/چند محیطی
9- ادغام متغیرهای کمکی محیطی در پیش بینی ژنومی
10- آموزش انتقالی
زبان آموزش: انگلیسی
ثبت نام و اسکان:
اطلاعات به زودی اعلام خواهد شد. دوره رایگان خواهد بود اما وجود خواهد داشت
هزینه ای برای استراحت قهوه و ناهار باشد.
لطفاً با ارسال یک ایمیل به هر یک، قصد خود را برای شرکت در جلسه اعلام کنید
مخاطبین ارائه شده در زیر از آنجایی که محدودیتی در تعداد وجود خواهد داشت
شرکت کنندگان، اولین حضور، اولین خدمت.
محل برگزاری: انستیتو پاستور مونته ویدئو، اروگوئه. https://pasteur.uy/en/
شرکت کنندگان: باید لپ تاپ همراه داشته باشند و ترتیب اقامت و سفر را بدهند.
تماس:
دانیل جیانولا (dgianola@inia.org.uy)
اولگا راواگنولو (oravagnolo@inia.org.uy)
دانیل جیانولا
سوال رایت، استاد بازنشسته اصلاح نژاد و ژنتیک حیوانات
گروه علوم دامی و لبنیات
دانشگاه ویسکانسین-مدیسون
256 ساختمان علوم دامی
رصدخانه 1675 Dr.
مدیسون، WI 53706
ایالات متحده آمریکا
https://andysci.wisc.edu/directory/dan-gianola/
https://en.wikipedia.org/wiki/Daniel_Gianola
https://scholar.google.com/citations?user=bikTUXkAAAAJ&hl=en&oi=ao
https://qbi.wisc.edu/research/all-faculty/
"طبیعت به زبان ریاضی (گالیله) نوشته شده است.
قضیه بیز را امتحان کنید"
«روشهای بیزی با اولویتهای ذهنی ممکن است فرآیندها را از بین ببرد
علم» (اقتباس شده از اسکار کمپتورن)
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+ لغو اشتراک / دریافت خلاصه فهرست / انصراف / حذف حساب خود:
همه گزینه ها در دست شماست: https://www.animalgenome.org/angendir
+ https://www.animalgenome.org | دفتر راهنمایی: bioinfo-team@animalgenome.org